Obtenção de marcadores microssatélites para Pseudoplatystoma reticulatum a partir de primers heterólogos

Autores

DOI:

https://doi.org/10.5433/1679-0359.2021v42n3p1323

Palavras-chave:

B. rousseauxii, Cachara, Genetic variability, Heterologous markers, Population genetics, P. punctifer.

Resumo

Estudos acerca da composição genética de populações de peixes contribuem para a elaboração de práticas conservacionista, bem como para controle da consanguinidade em estoques de piscicultura. Neste sentido, ferramentas moleculares como os marcadores microssatélites (SSR’s) são comumente utilizados, contudo, seu desenvolvimento corresponde a um processo caro e demorado. Surge como alternativa a utilização dos marcadores heterólogos, originalmente desenvolvidos para uma espécie, mas que podem ser utilizados de maneira rápida em outras taxonomicamente relacionadas. O objetivo desta pesquisa foi testar de maneira inédita a utilização de marcadores SSR’s de Brachyplatystoma rousseauxi e Pseudoplatystoma punctifer em P. reticulatum. Para tanto, foram extraídas amostras de DNA a partir de fragmentos de nadadeira caudal de 222 indivíduos adultos de P. reticulatum por metodologia a base de NaCl. As amostras foram então amplificadas por Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizando-se seis marcadores, quatro de B. rousseauxi (BR38, 47, 51 e 61) e dois de P. punctifer (PPU13 e PPU15). Dois primers apresentaram amplificação inespecífica e foram desconsiderados (BR38 e PPU13). Entre os quatro restantes, o número de alelos por locus variou entre dois (BR47) a dezesseis (BR51), com tamanho médio de alelos entre 142 e 400 pb. O número efetivo médio de alelos por locus variou de 10,650 (BR51) à 1,784 (BR47), com alelos nulos ou de baixa frequência presentes em todos os loci estudados. Os valores de heterozigosidade observada variaram de 0,299 (BR47) à 0,640 (BR51), e foram sempre menores que os de heterozigosidade esperada. O Equilíbrio de Hardy-Weinberg foi significativo (P < 0,05) em todos os locus e o coeficiente de endogamia Fis sempre apresentou valores positivos. Os valores de Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) confirmaram a eficiência dos marcadores utilizados, já que possuíram de moderado (BR47) a alto nível de informação (BR51, BR61 e PPU15). O teste de transferibilidade de marcadores moleculares microssatélites heterólogos, originalmente desenvolvidos para B. rousseauxi e P. punctifer em P. reticulatum se mostrou eficiente, produzindo três primers com alto nível de informação, fato que garante sua utilização segura em estudos populacionais futuros voltados à esta espécie.

Biografia do Autor

Jefferson Murici Penafort, Universidade Federal Rural da Amazônia

Prof. Dr., Universidade Federal Rural da Amazônia, Instituto Socioambiental e Recursos Hídricos, ISARH / UFRA, Belém, PA, Brasil.

Laís Santana Celestino Mantovani, Universidade Estadual de Maringá

Ph.D. Discente do Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Estadual de Maringá, UEM, Maringá, PR, Brasil.

Gabriela Hernandes Granzoto, Universidade Estadual de Maringá

Graduando em Zootecnia, UEM, Maringá, PR, Brasil.

Pedro Luiz de Castro, Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul

Pesquisador, Fundação de Apoio ao Desenvolvimento da Educação, Ciência e Tecnologia do Estado de Mato Grosso do Sul, FUNDECT, Aquidauana, MS, Brasil.

Luiz Fernando de Souza Alves, Universidade Estadual de Maringá

Ph.D. Discente do Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Estadual de Maringá, UEM, Maringá, PR, Brasil.

Felipe Pinheiro de Souza, Universidade Estadual de Londrina

Ph.D. Discente do Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Estadual de Londrina, UEL, Londrina, PR, Brasil.

Nelson Maurício Lopera-Barrero, Universidade Estadual de Londrina

Prof. Dr., Departamento de Zootecnia, UEL, Londrina, PR, Brasil.

Carlos Antônio Lopes de Oliveira, Universidade Estadual de Maringá

Prof. Ph.D., UEM, Maringá, PR, Brasil.

Ricardo Pereira Ribeiro, Universidade Estadual de Maringá

Prof. Ph.D., UEM, Maringá, PR, Brasil.

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Publicado

2021-03-19

Como Citar

Penafort, J. M., Mantovani, L. S. C., Granzoto, G. H., Castro, P. L. de, Alves, L. F. de S., Souza, F. P. de, … Ribeiro, R. P. (2021). Obtenção de marcadores microssatélites para Pseudoplatystoma reticulatum a partir de primers heterólogos. Semina: Ciências Agrárias, 42(3), 1323–1334. https://doi.org/10.5433/1679-0359.2021v42n3p1323

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