Diversidade genética de populações de peixes migratórios do reservatório do Rio Grande (São Paulo, Brasil)
DOI:
https://doi.org/10.5433/1679-0359.2019v40n1p503Palavras-chave:
Brycon orbignyanus, Conservação, Microssatélites, Piaractus mesopotamicus, Prochilodus lineatus, Variabilidade genética.Resumo
Nos últimos anos, fatores antrópicos como poluição, sobrepesca e construção de hidrelétricas têm impactado significativamente as populações naturais de peixes. Pesquisas que permitam avaliar geneticamente esse impacto são necessárias para orientar objetivamente programas de conservação. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de populações de Curimba (Prochilodus lineatus), Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piracanjuba (Brycon orbignyanus) provenientes do reservatório de Água Vermelha, Rio Grande-SP. Foram amplificados loci microssatélites que produziram 56, 24 e 26 alelos para as populações das três espécies, respectivamente. O número de alelos por locus variou de três a dez para P. lineatus, dois a cinco para P. mesopotamicus e dois a quatro para B. orbignianus. A heterozigosidade observada (Ho) foi mais elevada na população de P. lineatus (0,547) em relação às populações de P. mesopotamicus e B. orbignyanus (0,473 e 0,527, respectivamente). A média dos valores de Ho foram inferiores à média de He nas três espécies sendo corroborado pelo Fis positivo observado. Foi encontrado desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg (HWE) em cinco loci para P. lineatus, três loci para P. mesopotamicus e dois em B. orbignyanus. A análise de bottleneck revelou excesso de heterozigotos (p < 0,05) pelo teste de Wilcoxon nas três espécies apenas no modelo Infinite Allele Model (IAM). Foi observada adequada variabilidade genética nas três populações com a presença de déficit de heterozigotos.Downloads
Não há dados estatísticos.
Referências
AGOSTINHO, A. A.; GOMES, L. C.; SANTOS, N. C.; ORTEGA, J. C.; PELICICE, F. M. Fish assemblages in Neotropical reservoirs: colonization patterns, impacts and management. Fisheries Research, Amsterdam, v. 173, n. 1, p. 26-36, 2016.
AGOSTINHO, A. A.; PELICICE, F. M.; GOMES, L. C. Dams and the fish fauna of the Neotropical region: impacts and management related to diversity and fisheries. Brazilian Journal of Biology, São Carlos, v. 68, n. 4, p. 1119-1132, 2008. Supplement.
ASHIKAGA, F. Y.; ORSI, M. L.; OLIVEIRA, C.; SENHORINI, J. A.; FORESTI, F. The endangered species Brycon orbignyanus: genetic analysis and definition of priority areas for conservation. Environmental Biology of Fishes, Dordrecht, v. 98, n. 7, p. 1845-1855, 2015.
BARBOSA, A. C.; CORREA, T. C.; GALZERANI, F.; GALETTI, P. M.; HATANAKA, T. Thirteen polymorphic microsatellite loci in the Neotropical fish Prochilodus argenteus (Characiformes, Prochilodontidae). Molecular Ecology Resources, Oxford, v. 6, n. 3, p. 936-938, 2006.
BARBOSA, A. C.; GALZERANI, F.; CORRÊA, T. C.; GALETTI JUNIOR, P. M.; HATANAKA, T. Description of novel microsatellite loci in the Neotropical fish Prochilodus argenteus and cross-amplification in P. costatus and P. lineatus. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 31, n. 1, p. 357-360, 2008.
BARROCA, T. M.; SANTOS, G. B.; DUARTE, N. V. R.; KALAPOTHAKIS, E. Evaluation of genetic diversity and population structure in a commercially important freshwater fish Prochilodus costatus (Characiformes, Prochilodontidae) using complex hypervariable repeats. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 11, n. 4, p. 4456-4467, 2012.
BARROSO, R. M.; HILSDORF, A. W. S.; MOREIRA, H. L. M.; MELLO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; CABELLO, P. H.; TRAUB-CSEKO, Y. M. Identification and characterization of microsatellites loci in Brycon opalinus (Cuvier, 1819) (Characiforme, Characidae, Bryconiae). Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 3, n. 1, p. 297-298, 2003.
BASSAM, B. J.; CAETANO-ANOLLÉS, G.; GRESSHOFF, P. M. Fast and sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels. Analytical Biochemistry, Bethesda, v. 196, n. 2, p. 80-83, 1991.
CALCAGNOTTO, D.; DESALLE, R. Population genetic structuring in pacu (Piaractus mesopotamicus) across the parana-paraguay basin: evidence from microsatellites. Neotropical Ichthyology, Maringá, v. 7, n. 4, p. 607-616, 2009.
CALCAGNOTTO, D.; RUSSELLO, M.; DESALLE, R. Isolation and characterization of microsatellite loci in Piaractus mesopotamicus and their applicability in other Serrasalminae fish. Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 1, n. 4, p. 245-247, 2001.
CARVALHO-COSTA, L. F.; HATANAKA, T.; GALETTI JUNIOR, P. M. Evidence of lack of population substructuring in the Brazilian freshwater fish Prochilodus costatus. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 31, n. 1, p. 377-380, 2008.
CASTRO, P. L.; RIBEIRO, R. P.; SANTOS, S. C. A.; GOES, E. S. D. R.; SOUZA, F. P.; POVEDA-PARRA, A. R.; VARGAS, L.; URREA-ROJAS, A. M.; LOPERA-BARRERO, N. M. Cross-amplification of heterologous microsatellite markers in Piracanjuba. Ciência Rural, Santa Maria, v. 47, n. 12, p. 1-6, 2017.
CORNUET, J. M.; LUIKART, G. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data. Genetics, Rockville, v. 144, n. 4, p. 2001-2014, 1996.
FERREIRA, D. G.; SOUZA-SHIBATTA, L.; SHIBATTA, O. A.; SOFIA, S. H.; CARLSSON, J.; DIAS, J. H. P.; MAKRAKIS, S.; MAKRAKIS, M. C. Genetic structure and diversity of migratory freshwater fish in a fragmented Neotropical river system. Reviews in Fish Biology and Fisheries, London, v. 27, n. 1, p. 209-231, 2017.
GOUDET, J. FSTAT: a program to estimate and test gene diversities and fixation indices (version 2.9.3.2). Lausanne: University of Lausanne, Department of Ecology & Evolution, 2002. Disponível em: <http://www2.unil.ch/popgen/softwares/fstat.htm>. Acesso em: 26 jan. 2018.
INSTITUTO BRASILEIRO DE GEOGRAFIA E ESTATÍSTICA - IBGE. Produção da pecuária municipal 2015. Rio de Janeiro: IBGE, 2015. 49 p.
LAROCHE, J.; DURAND, J. D. Genetic structure of fragmented populations of a threatened endemic percid of the Rhône river: Zingel asper. Heredity, London, v. 92, n. 4, p. 329-334, 2004.
LOPERA-BARRERO, N. M.; POVH, J. A.; RIBEIRO, R. P.; GOMES, P. C.; JACOMETO, C. B.; LOPES, T. S. Comparación de protocolos de extracción de ADN con muestras de aleta y larva de peces: extracción modificada con cloruro de sodio. Ciencia e Investigación Agraria, Santiago, v. 35, n. 1, p. 76-86, 2008.
LOPERA-BARRERO, N. M.; SANTOS, S. C. A.; GOES, E. S. R.; CASTRO, P. L.; SOUZA, F. P.; POVEDA-PARRA, A. R.; CASSETA, J.; PONTILLO, B. G.; RIBEIRO, R. P. Monitoring and conservation genetics of Prochilodus lineatus wild populations of Pardo, Mogi Guaçu and Tiete rivers, São Paulo. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 68, n. 6, p. 1621-1628, 2016.
LOPERA-BARRERO, N. M.; SANTOS, S. C. A.; RODRIGUEZ-RODRIGUEZ, M. P.; FORNARI, D. C.; ZANCHETA, C.; POVEDA-PARRA, A. R.; OLIVEIRA, C. A. L.; RIBEIRO, R. P. Genetic diversity of wild populations and broodstocks of curimba for restocking programs in the Tietê, Grande, Pardo and Mogi-Guaçu rivers (Brazil). Boletim do Instituto de Pesca, São Paulo, v. 41, n. 2, p. 287-304, 2015.
POVH, J. A.; RIBEIRO, R. P.; SIROL, R. N.; STREIT JUNIOR, D. P.; MOREIRA, H. L. M.; SIEWERDT, F.; LOPERA-BARRERO, N. M.; MANGOLIN, C. A.; VARGAS, L. Microsatellite analysis of the parental contribution of Piaractus mesopotamicus to the production of offspring in the semi-natural system of reproduction. Brazilian Archives of Biology and Technology, Curitiba, v. 53, n. 2, p. 389-396, 2010.
RAMOS, J. V. B.; SODRÉ, L. M. K.; ORSI, M. L.; ALMEIDA, F. S. Genetic diversity of the species Leporinus elongatus (Teleostei: Characiformes) in the Canoas Complex - Paranapanema River. Neotropical Ichthyology, Maringá, v. 10, n. 4, p. 821-828, 2012.
REVALDAVES, E.; RENESTO, E.; GOLD, J. R. Genetic variation of Prochilodus lineatus (Valenciennes, 1836) from Paraná, Baía, Miranda, and Corumbá rivers, Brazil. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 15, n. 4, p. 1-11, 2016.
RIBEIRO, R. P.; LOPERA-BARRERO, N. M.; POVH, J. A.; RODRIGUEZ-RODRIGUEZ, M. P.; FORNARI, D. C.; BAUMGARTNER, G.; BAUMGARTNER, D.; SOUZA, F. P.; CASTRO, P. L.; POVEDA-PARRA, A. R. Genetic diversity of Salminus brasiliensis wild populations in downstream and upstream Cachoeira Branca, Verde River MS Brazil: a preliminary view. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 37, n. 1, p. 507-516, 2016.
RIBEIRO, R. P.; LOPERA-BARRERO, N. M.; SANTOS, S. C. A.; RODRIGUEZ-RODRIGUEZ, M. P.; OLIVEIRA, S. N.; ALEXANDRE FILHO, L.; VARGAS, L.; GOES, E. S. R.; CASTRO, P. L.; POVEDA-PARRA, A. R. Genetic diversity of pacu for restocking programs in the Tietê and Grande rivers, Brazil. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 36, n. 6, p. 3807-3826, 2015.
SANCHES, A.; GALETTI JUNIOR, P. M. Microsatellites loci isolated in the freshwater fish Brycon hilarii. Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 6, n. 4, p. 1045-1046, 2006.
SOUZA, F. P.; CASTRO, P. L.; GOES, E. S. R.; RIBEIRO, R. P.; SANTOS, S. C. A.; LIMA, E. C. S.; FURLAN MURARI, P. J.; LOPERA-BARRERO, N. M. Genetic variability of Prochilodus lineatus in artificial and semi-natural reproduction. Italian Journal of Animal Science, Bologna, v. 17, n. 2, p. 321-325, 2018.
WAGNER, R. L.; MAKRAKIS, S.; CASTRO-SANTOS, T.; MAKRAKIS, M. C.; DIAS, J. H. P.; BELMONT, R. F. Passage performance of long-distance upstream migrants at a large dam on the Paraná River and the compounding effects of entry and ascent. Neotropical Ichthyology, Maringá, v. 10, n. 4, p. 785-795, 2012.
YAZBECK, G. M.; KALAPOTHAKIS, E. Isolation and characterization of microsatellite DNA in the piracema fish Prochilodus lineatus (Characiformes). Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 6, n. 4, p. 1026-1034, 2007.
YEH, F. C.; BOYLE, T. Y. Z.; XIYAN, J. M. POPGENE version 131: microsoft window-based freeware for population genetic analysis. Alberta: University of Alberta and Center for International Forestry Research, 1999. 29 p.
AGOSTINHO, A. A.; PELICICE, F. M.; GOMES, L. C. Dams and the fish fauna of the Neotropical region: impacts and management related to diversity and fisheries. Brazilian Journal of Biology, São Carlos, v. 68, n. 4, p. 1119-1132, 2008. Supplement.
ASHIKAGA, F. Y.; ORSI, M. L.; OLIVEIRA, C.; SENHORINI, J. A.; FORESTI, F. The endangered species Brycon orbignyanus: genetic analysis and definition of priority areas for conservation. Environmental Biology of Fishes, Dordrecht, v. 98, n. 7, p. 1845-1855, 2015.
BARBOSA, A. C.; CORREA, T. C.; GALZERANI, F.; GALETTI, P. M.; HATANAKA, T. Thirteen polymorphic microsatellite loci in the Neotropical fish Prochilodus argenteus (Characiformes, Prochilodontidae). Molecular Ecology Resources, Oxford, v. 6, n. 3, p. 936-938, 2006.
BARBOSA, A. C.; GALZERANI, F.; CORRÊA, T. C.; GALETTI JUNIOR, P. M.; HATANAKA, T. Description of novel microsatellite loci in the Neotropical fish Prochilodus argenteus and cross-amplification in P. costatus and P. lineatus. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 31, n. 1, p. 357-360, 2008.
BARROCA, T. M.; SANTOS, G. B.; DUARTE, N. V. R.; KALAPOTHAKIS, E. Evaluation of genetic diversity and population structure in a commercially important freshwater fish Prochilodus costatus (Characiformes, Prochilodontidae) using complex hypervariable repeats. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 11, n. 4, p. 4456-4467, 2012.
BARROSO, R. M.; HILSDORF, A. W. S.; MOREIRA, H. L. M.; MELLO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; CABELLO, P. H.; TRAUB-CSEKO, Y. M. Identification and characterization of microsatellites loci in Brycon opalinus (Cuvier, 1819) (Characiforme, Characidae, Bryconiae). Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 3, n. 1, p. 297-298, 2003.
BASSAM, B. J.; CAETANO-ANOLLÉS, G.; GRESSHOFF, P. M. Fast and sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels. Analytical Biochemistry, Bethesda, v. 196, n. 2, p. 80-83, 1991.
CALCAGNOTTO, D.; DESALLE, R. Population genetic structuring in pacu (Piaractus mesopotamicus) across the parana-paraguay basin: evidence from microsatellites. Neotropical Ichthyology, Maringá, v. 7, n. 4, p. 607-616, 2009.
CALCAGNOTTO, D.; RUSSELLO, M.; DESALLE, R. Isolation and characterization of microsatellite loci in Piaractus mesopotamicus and their applicability in other Serrasalminae fish. Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 1, n. 4, p. 245-247, 2001.
CARVALHO-COSTA, L. F.; HATANAKA, T.; GALETTI JUNIOR, P. M. Evidence of lack of population substructuring in the Brazilian freshwater fish Prochilodus costatus. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 31, n. 1, p. 377-380, 2008.
CASTRO, P. L.; RIBEIRO, R. P.; SANTOS, S. C. A.; GOES, E. S. D. R.; SOUZA, F. P.; POVEDA-PARRA, A. R.; VARGAS, L.; URREA-ROJAS, A. M.; LOPERA-BARRERO, N. M. Cross-amplification of heterologous microsatellite markers in Piracanjuba. Ciência Rural, Santa Maria, v. 47, n. 12, p. 1-6, 2017.
CORNUET, J. M.; LUIKART, G. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data. Genetics, Rockville, v. 144, n. 4, p. 2001-2014, 1996.
FERREIRA, D. G.; SOUZA-SHIBATTA, L.; SHIBATTA, O. A.; SOFIA, S. H.; CARLSSON, J.; DIAS, J. H. P.; MAKRAKIS, S.; MAKRAKIS, M. C. Genetic structure and diversity of migratory freshwater fish in a fragmented Neotropical river system. Reviews in Fish Biology and Fisheries, London, v. 27, n. 1, p. 209-231, 2017.
GOUDET, J. FSTAT: a program to estimate and test gene diversities and fixation indices (version 2.9.3.2). Lausanne: University of Lausanne, Department of Ecology & Evolution, 2002. Disponível em: <http://www2.unil.ch/popgen/softwares/fstat.htm>. Acesso em: 26 jan. 2018.
INSTITUTO BRASILEIRO DE GEOGRAFIA E ESTATÍSTICA - IBGE. Produção da pecuária municipal 2015. Rio de Janeiro: IBGE, 2015. 49 p.
LAROCHE, J.; DURAND, J. D. Genetic structure of fragmented populations of a threatened endemic percid of the Rhône river: Zingel asper. Heredity, London, v. 92, n. 4, p. 329-334, 2004.
LOPERA-BARRERO, N. M.; POVH, J. A.; RIBEIRO, R. P.; GOMES, P. C.; JACOMETO, C. B.; LOPES, T. S. Comparación de protocolos de extracción de ADN con muestras de aleta y larva de peces: extracción modificada con cloruro de sodio. Ciencia e Investigación Agraria, Santiago, v. 35, n. 1, p. 76-86, 2008.
LOPERA-BARRERO, N. M.; SANTOS, S. C. A.; GOES, E. S. R.; CASTRO, P. L.; SOUZA, F. P.; POVEDA-PARRA, A. R.; CASSETA, J.; PONTILLO, B. G.; RIBEIRO, R. P. Monitoring and conservation genetics of Prochilodus lineatus wild populations of Pardo, Mogi Guaçu and Tiete rivers, São Paulo. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 68, n. 6, p. 1621-1628, 2016.
LOPERA-BARRERO, N. M.; SANTOS, S. C. A.; RODRIGUEZ-RODRIGUEZ, M. P.; FORNARI, D. C.; ZANCHETA, C.; POVEDA-PARRA, A. R.; OLIVEIRA, C. A. L.; RIBEIRO, R. P. Genetic diversity of wild populations and broodstocks of curimba for restocking programs in the Tietê, Grande, Pardo and Mogi-Guaçu rivers (Brazil). Boletim do Instituto de Pesca, São Paulo, v. 41, n. 2, p. 287-304, 2015.
POVH, J. A.; RIBEIRO, R. P.; SIROL, R. N.; STREIT JUNIOR, D. P.; MOREIRA, H. L. M.; SIEWERDT, F.; LOPERA-BARRERO, N. M.; MANGOLIN, C. A.; VARGAS, L. Microsatellite analysis of the parental contribution of Piaractus mesopotamicus to the production of offspring in the semi-natural system of reproduction. Brazilian Archives of Biology and Technology, Curitiba, v. 53, n. 2, p. 389-396, 2010.
RAMOS, J. V. B.; SODRÉ, L. M. K.; ORSI, M. L.; ALMEIDA, F. S. Genetic diversity of the species Leporinus elongatus (Teleostei: Characiformes) in the Canoas Complex - Paranapanema River. Neotropical Ichthyology, Maringá, v. 10, n. 4, p. 821-828, 2012.
REVALDAVES, E.; RENESTO, E.; GOLD, J. R. Genetic variation of Prochilodus lineatus (Valenciennes, 1836) from Paraná, Baía, Miranda, and Corumbá rivers, Brazil. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 15, n. 4, p. 1-11, 2016.
RIBEIRO, R. P.; LOPERA-BARRERO, N. M.; POVH, J. A.; RODRIGUEZ-RODRIGUEZ, M. P.; FORNARI, D. C.; BAUMGARTNER, G.; BAUMGARTNER, D.; SOUZA, F. P.; CASTRO, P. L.; POVEDA-PARRA, A. R. Genetic diversity of Salminus brasiliensis wild populations in downstream and upstream Cachoeira Branca, Verde River MS Brazil: a preliminary view. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 37, n. 1, p. 507-516, 2016.
RIBEIRO, R. P.; LOPERA-BARRERO, N. M.; SANTOS, S. C. A.; RODRIGUEZ-RODRIGUEZ, M. P.; OLIVEIRA, S. N.; ALEXANDRE FILHO, L.; VARGAS, L.; GOES, E. S. R.; CASTRO, P. L.; POVEDA-PARRA, A. R. Genetic diversity of pacu for restocking programs in the Tietê and Grande rivers, Brazil. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 36, n. 6, p. 3807-3826, 2015.
SANCHES, A.; GALETTI JUNIOR, P. M. Microsatellites loci isolated in the freshwater fish Brycon hilarii. Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 6, n. 4, p. 1045-1046, 2006.
SOUZA, F. P.; CASTRO, P. L.; GOES, E. S. R.; RIBEIRO, R. P.; SANTOS, S. C. A.; LIMA, E. C. S.; FURLAN MURARI, P. J.; LOPERA-BARRERO, N. M. Genetic variability of Prochilodus lineatus in artificial and semi-natural reproduction. Italian Journal of Animal Science, Bologna, v. 17, n. 2, p. 321-325, 2018.
WAGNER, R. L.; MAKRAKIS, S.; CASTRO-SANTOS, T.; MAKRAKIS, M. C.; DIAS, J. H. P.; BELMONT, R. F. Passage performance of long-distance upstream migrants at a large dam on the Paraná River and the compounding effects of entry and ascent. Neotropical Ichthyology, Maringá, v. 10, n. 4, p. 785-795, 2012.
YAZBECK, G. M.; KALAPOTHAKIS, E. Isolation and characterization of microsatellite DNA in the piracema fish Prochilodus lineatus (Characiformes). Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 6, n. 4, p. 1026-1034, 2007.
YEH, F. C.; BOYLE, T. Y. Z.; XIYAN, J. M. POPGENE version 131: microsoft window-based freeware for population genetic analysis. Alberta: University of Alberta and Center for International Forestry Research, 1999. 29 p.
Downloads
Publicado
2019-02-15
Como Citar
Lopera-Barrero, N. M., Souza, F. P. de, Lima, E. C. S. de, Urrea-Rojas, A. M., Castro, P. L. de, Goes, E. S. dos R., … Ribeiro, R. P. (2019). Diversidade genética de populações de peixes migratórios do reservatório do Rio Grande (São Paulo, Brasil). Semina: Ciências Agrárias, 40(1), 503–510. https://doi.org/10.5433/1679-0359.2019v40n1p503
Edição
Seção
Comunicações
Licença
Copyright (c) 2019 Semina: Ciências Agrárias
Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Semina: Ciências Agrárias adota para suas publicações a licença CC-BY-NC, sendo os direitos autorais do autor, em casos de republicação recomendamos aos autores a indicação de primeira publicação nesta revista.
Esta licença permite copiar e redistribuir o material em qualquer meio ou formato, remixar, transformar e desenvolver o material, desde que não seja para fins comerciais. E deve-se atribuir o devido crédito ao criador.
As opiniões emitidas pelos autores dos artigos são de sua exclusiva responsabilidade.
A revista se reserva o direito de efetuar, nos originais, alterações de ordem normativa, ortográfica e gramatical, com vistas a manter o padrão culto da língua e a credibilidade do veículo. Respeitará, no entanto, o estilo de escrever dos autores. Alterações, correções ou sugestões de ordem conceitual serão encaminhadas aos autores, quando necessário.
