Epimarcas do cromossomo B de Astatotilapia latifasciata e causas e efeitos deste elemento na expressão de genes da maquinaria de metilação do DNA

Autores

  • Adauto Lima Cardoso Universidade Estadual Paulista
  • Bruno Evaristo de Almeida Fantinatti Universidade Estadual Paulista
  • Natália Bortholazzi Venturelli Universidade Estadual Paulista
  • Bianca de Oliveira Carmello Universidade Estadual Paulista
  • Rogério Antônio de Oliveira Universidade Estadual Paulista
  • Cesar Martins Universidade Estadual Paulista

DOI:

https://doi.org/10.5433/1679-0367.2017v38n1suplp159

Palavras-chave:

Imunocitogenética, Epi-miRNAs, Expressão gênica, Epigenética

Resumo

Cromossomos supernumerários são polimorfismos numéricos frequentemente registrados em eucariotos, sendo que seus efeitos são pouco elucidados. Em alguns indivíduos da espécie Astatotilapia latifasciata pode-se identificar um ou dois isocromossomos B, que são totalmente heterocromáticos. Em vista de compreender sua origem, evolução e efeitos, este elemento vem sendo largamente explorado por técnicas integradas de citogenética, biologia molecular e genômica. Dados prévios revelam seus efeitos na expressão de diversas classes de RNAs canônicos. É possível que estes efeitos sejam consequências de alterações epigenéticas, semelhante ao que ocorre em aneuploidias. Assim, o objetivo deste estudo foi identificar o padrão de epimarcas do DNA no cromossomo B de A. latifasciata e as causas e efeitos deste cromossomo na expressão de genes da maquinaria de metilação do DNA (Dnmt1, Dnmt3a, Dnmt3b, Tet1, Tet2, Tet3 e Tdg). Para isso, foram empregadas técnicas de imunocitogenética usando-se anticorpos contra metilcitosina (5mC) e hidroximetilcitosina (5hmC) em cromossomos metafásicos do rim cefálico, expressão de mRNAs e epi-miRNAs (miRNAs que regulam genes da maquinaria epigenética) por RT-qPCR e quantificação global dos conteúdos de 5mC e 5hmC com uso dos kits MethylFlash™ Methylated DNA Quantification e MethylFlash™ Hydroxymethylated DNA Quantification (Epigentek), respectivamente. Nos experimentos de RT-qPCR e quantificação global de 5mC e 5hmC foram avaliados os tecidos: cérebro, músculo e gônadas. Predição de epi-miRNAs foi realizada pelos programas PITA, miRanda e RNAhybrid. Os dados foram comparados com uso do test t e de um modelo linear generalizado com médias ajustadas pela distribuição gama (GENMOD). Os resultados indicam que o cromossomo B possui um padrão de marcas de 5mC e 5hmC semelhante ao complemento A, mas com distinção entre seus braços. Além disso, foram identificados efeitos heterogêneos deste cromossomo na expressão de epi-miRNAs e mRNAs e no conteúdo global de 5mC e 5hmC. Esse conjunto de dados reforça a hipótese de que mecanismos epigenéticos são afetados pelo cromossomo B, o que pode explicar as diferenças previamente observadas na expressão de RNAs canônicos. Além disso, estes dados estão em desacordo com a ideia mais difundida de que cromossomos B sejam elementos inertes.

 

Apoio: FAPESP, CNPq, CAPES.

Downloads

Não há dados estatísticos.

Biografia do Autor

Adauto Lima Cardoso, Universidade Estadual Paulista

Departamento de Morfologia, Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brasil

Bruno Evaristo de Almeida Fantinatti, Universidade Estadual Paulista

Departamento de Morfologia, Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brasil

Natália Bortholazzi Venturelli, Universidade Estadual Paulista

Departamento de Morfologia, Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brasil

Bianca de Oliveira Carmello, Universidade Estadual Paulista

Departamento de Morfologia, Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brasil

Rogério Antônio de Oliveira, Universidade Estadual Paulista

Departamento de Estatística, Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brasi

Cesar Martins, Universidade Estadual Paulista

Departamento de Morfologia, Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brasil

Downloads

Publicado

2018-02-16

Como Citar

1.
Cardoso AL, Fantinatti BE de A, Venturelli NB, Carmello B de O, Oliveira RA de, Martins C. Epimarcas do cromossomo B de Astatotilapia latifasciata e causas e efeitos deste elemento na expressão de genes da maquinaria de metilação do DNA. Semin. Cienc. Biol. Saude [Internet]. 16º de fevereiro de 2018 [citado 9º de outubro de 2024];38(1supl):159. Disponível em: https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/seminabio/article/view/29984