Avaliação de softwares para análises de citometria de fluxo em bananeira

Authors

  • Renata Alves Lara Silva Universidade Federal de Lavras
  • Leila Aparecida Salles Pio Universidade Federal de Lavras
  • Moacir Pasqual Universidade Federal de Lavras
  • Ana Catarina Lima de Oliveira Universidade Federal de Sergipe
  • Filipe Almendagna Rodrigues Universidade Federal de Lavras
  • Sebastião de Oliveira e Silva Embrapa

DOI:

https://doi.org/10.5433/1679-0359.2014v35n2p775

Keywords:

Coeficiente de variação, Conteúdo de DNA, CellQuest™, WinMDI™, FlowJo™, FCS Express™.

Abstract

A citometria de fluxo é uma técnica que apresenta resultados com extrema rapidez para análises de propriedades celulares como volume, complexidade morfológica e conteúdo de DNA, e é considerada mais conveniente que outras técnicas. Entretanto, as análises muitas vezes geram histogramas com variações que podem ser devidas a vários fatores, dentre os quais, as diferenças entre os softwares que realizam a aquisição dos dados gerados pelo citômetro de fluxo. Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar o desempenho de quatro softwares comumente utilizados em análises de citometria de fluxo, por meio de quantificações do conteúdo de DNA e análises do coeficiente de variação gerados por eles. Foram realizadas leituras de 25 amostras foliares de bananeira ‘NBA’ (AA) utilizando o citômetro de fluxo modelo FACSCalibur (BD) e 25 histogramas de cada software (CellQuest™, WinMDI™, FlowJo™  e FCS Express™) foram analisados para obtenção do conteúdo de DNA estimado e do coeficiente de variação das estimativas. Não há diferença entre os softwares quanto aos valores de conteúdo de DNA. Entretanto, as análises do CV indicaram que a precisão do software WinMDI™ foi baixa e que os valores de CV foram subestimados, enquanto que os demais softwares apresentaram valores de CV mais condizentes com a literatura. O software CellQuest™ é recomendado por ser desenvolvido pela própria empresa fabricante do citômetro de fluxo utilizado nas análises do presente trabalho.

Author Biographies

Renata Alves Lara Silva, Universidade Federal de Lavras

Doctoral Student, Federal University of Lavras, UFLA, Lavras, MG, Brasil.

Leila Aparecida Salles Pio, Universidade Federal de Lavras

Prof. of Federal University of Lavras, UFLA, Lavras, MG, Brasil.

Moacir Pasqual, Universidade Federal de Lavras

Prof. of Federal University of Lavras, UFLA, Lavras, MG, Brasil.

Ana Catarina Lima de Oliveira, Universidade Federal de Sergipe

Prof. of Federal Institute of Sergipe, IFS, Nossa Senhora da Glória, SE, Brasil.

Filipe Almendagna Rodrigues, Universidade Federal de Lavras

Post Doctoral Fellow, Federal University of Lavras, UFLA, Lavras, MG, Brasil.

Sebastião de Oliveira e Silva, Embrapa

Researcher of Brazilian Agricultural Research Corporation, EMBRAPA, Cruz das Almas, BA, Brasil.

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Published

2014-04-28

How to Cite

Silva, R. A. L., Pio, L. A. S., Pasqual, M., Oliveira, A. C. L. de, Rodrigues, F. A., & Silva, S. de O. e. (2014). Avaliação de softwares para análises de citometria de fluxo em bananeira. Semina: Ciências Agrárias, 35(2), 775–780. https://doi.org/10.5433/1679-0359.2014v35n2p775

Issue

Section

Communication

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