Caracterização do Transcriptoma da Soja Frente à Inoculação de Nematóide Causador de Lesões Radiculares

Authors

  • Valéria Stefania Lopes-Caitar Departamento de Ciência da Computação, Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Cornélio Procópio-Paraná, CEP 86300-000
  • Luciano Nobuhiro Aoyagi Departamento de Bioquímica e Biotecnologia, Universidade Estadual de Londrina, Londrina-Paraná
  • Luana Mieko Darben Departamento de Ciências Biológicas, Universidade Estadual de Maringá, Maringá-Paraná
  • Adriana Maria Polizel-Podanosqui Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária – EMBRAPA Soja, Londrina-Paraná
  • Mayra Costa da Cruz Gallo De Carvalho Departamento de Ciências Biológicas, Universidade Estadual do Norte do Paraná, Bandeirantes-Paraná
  • Marcia Kamogae Kuwahara Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária – EMBRAPA Soja, Londrina-Paraná
  • Waldir Pereira Dias Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária – EMBRAPA Soja, Londrina-Paraná
  • Francismar Corrêa Marcelino-Guimarães Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária – EMBRAPA Soja, Londrina-Paraná

DOI:

https://doi.org/10.5433/2316-5200.2013v2n3espp34

Keywords:

RNA-seq, interação soja - nematóide, mecanismos moleculares de resistência, Pratylenchus brachyurus.

Abstract

Os nematóides causadores de lesões radiculares (Pratylenchus sp.) representam um dano grave para a soja e outras culturas agrícolas, causando impactos econômicos globais. Para identificar genes diferencialmente expressos (GDE) na interação planta-nematóide, genótipos suscetível (TGM 115 RR) e resistente (BRSGO Chapadões) foram inoculados com o nematóide, Pratylenchus brachyurus, e bibliotecas de RNA-seq de raízes inoculadas em quatro diferentes tempos pós-inoculação foram construídas. Assim, no presente estudo, foi realizada a caracterização do transcriptoma de dois genótipos de soja durante a interação inicial com nematóide da lesão radicular. RNA foi extraído das raízes dos dois genótipos e sequenciado com a plataforma Genome Analyzer. Os reads single-end foram mapeados nos transcritos preditos de soja para a identificação dos genes expressos. Um total de 1.766 e 2.464 DGE foram identificados nos genótipos resistente e suscetível, respectivamente. Um número maior de GDE associados à resposta ao estresse (GO) foi identificado no genótipo resistenteem relação ao suscetível, em todos os tratamentos.


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Published

2013-07-31

Issue

Vol. 2 No. 3esp (2013): Anais do III Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia 2013

Section

III SIMBBTEC 2013 Trabalhos completos - Seção: ORAL

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