Biblioteca subtrativa de raízes de soja em resposta à inoculação com Bradyrhizobium japonicum

Resumo

 

A soja [Glycine max (L.) Merr.] é uma leguminosa de grande expressão mundial, com valor econômico atribuído, principalmente, ao teor proteico elevado dos grãos, que, por sua vez, demandam altas doses de nitrogênio. Uma fonte de nitrogênio ambientalmente favorável e de baixo custo para os agricultores é representada pela fixação biológica do nitrogênio atmosférico, que ocorre através da associação com bactérias simbióticas. Na soja, essa associação ocorre, principalmente, com bactérias das espécies Bradyrhizobium japonicum e Bradyrhizobium elkanii, mas o conhecimento sobre a expressão gênica associada com a simbiose ainda é escasso. Este trabalho – parte integrante do Consórcio do Genoma da Soja (Genosoja) – foi conduzido com o objetivo de obter um melhor entendimento sobre a funcionalidade dos genes expressos nas raízes de soja nos estágios iniciais da interação com B. japonicum. O estudo foi conduzido com plantas de soja cultivadas sob condições de casa de vegetação, inoculadas (ou não) com a estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079) de B. japonicum, utilizada em larga escala em inoculantes comerciais no Brasil. O RNA foi extraídos das raízes, o mRNA foi isolado e a biblioteca subtrativa construída. O Sequenciamento gerou 4.621.072 leituras que, após a montagem resultaram em 3.776 sequências, definidas como diferencialmente expressas dos tratamentos inoculado versus não inoculado. As sequências foram agrupadas de acordo com sua função molecular, que resultou nas categorias de atividade antioxidante, transdução molecular, transporte, regulação de atividades enzimáticas, mas com ênfase nas atividades catalíticas e de ligação/sinalização molecular.